Rumo à Seleção Genômica Prática de Embriões em Bovinos: Um Fluxo de Trabalho Otimizado que Permite Predição de Valores Genéticos com Alta Precisão Sem Comprometer a Sobrevivência dos Embriões

A implementação da seleção genômica de embriões (SGE) é limitada pela ausência de um fluxo de trabalho padronizado que equilibre alta precisão de genotipagem com a preservação da viabilidade dos embriões, especialmente devido à heterogeneidade embrionária. Para abordar isso, otimizamos sistematicamente etapas críticas da biópsia do trofectoderma e da amplificação do genoma completo, estabelecendo uma estratégia estratificada por diâmetro que relaciona o diâmetro do embrião a uma janela de área de biópsia projetada para proteger a recuperação do embrião enquanto assegura entrada suficiente de DNA para uma genotipagem confiável. Nossos resultados demonstraram alta concordância (> 98%) entre os valores genéticos estimados genômicos (GEBVs) de embriões e bezerros, apoiando a confiabilidade das predições. Crucialmente, definimos uma estrutura de biópsia baseada no diâmetro: para embriões 2 apoiaram a viabilidade, enquanto embriões maiores (≥ 150 μm) toleraram até 1500 μm2, com um limite mínimo de 840 μm2 garantindo taxas de chamada de genótipos > 90%. Ao prevenir superamostragem em embriões pequenos e subamostragem em diferentes tamanhos de embriões, esse controle guiado pelo diâmetro melhora tanto a sobrevivência do embrião quanto a precisão da predição dos GEBVs. Este estudo fornece um caminho técnico validado para SGE que aborda o principal gargalo prático na reprodução animal. Ao assegurar seleção confiável sem comprometer o potencial de desenvolvimento, nosso trabalho facilita a introgressão rápida de genética superior e marca um passo significativo para tornar a SGE escalável, acelerando o progresso genético em bovinos e outras espécies.