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Neoantígenos associados a mutações (MANA) são um alvo da imunidade antitumoral de células T. Testes sensíveis, simples e padronizados são necessários para avaliar o repertório de células T específicas para MANA funcionais na oncologia. Testes que analisam a produção de citocinas in vitro, como ELISpot e coloração intracelular de citocinas, têm sido úteis, mas apresentam sensibilidade limitada na avaliação das respostas de células T específicas para tumores e não analisam repertórios de células T específicas para antígenos. O teste FEST (Expansão Funcional de Células T Específicas) descrito aqui integra o sequenciamento do receptor de células T de culturas estimuladas com peptídeos em curto prazo com uma plataforma bioinformática para identificar ampliações clonotípicas específicas para antígenos. Este teste pode ser adaptado para todos os tipos de antígenos, incluindo MANAs, por meio da previsão guiada pelo exoma tumoral de MANAs. Após a identificação in vitro pelo teste MANAFEST, a sequência CDR3 específica para MANA pode ser utilizada como um código de barras molecular para detectar e monitorar a dinâmica desses clonótipos no sangue, tumor e tecido normal de pacientes recebendo imunoterapia. O MANAFEST é compatível com práticas clínicas e laboratoriais rotineiras de alto rendimento. Cancer Immunol Res; 6(8); 888-99. ©2018 AACR.
Danilova et al. (Ter,) estudaram essa questão.