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O wwPDB recentemente lançou uma ferramenta de deposição, biocuração e validação: OneDep. Em várias etapas do processamento de dados do OneDep, relatórios de validação para estruturas tridimensionais de macromoléculas biológicas são produzidos. Esses relatórios são baseados em recomendações de grupos de especialistas representando as comunidades de cristalografia, ressonância magnética nuclear e microscopia crioeletrônica. Os relatórios fornecem métricas úteis com as quais os depositantes podem avaliar a qualidade dos dados experimentais, o modelo estrutural e o ajuste entre eles. O módulo de validação também está disponível como um servidor web autônomo e como um serviço web acessível programaticamente. Um número crescente de periódicos exige que os relatórios de validação oficiais do wwPDB (produzidos na biocuração) acompanhem manuscritos que descrevem estruturas macromoleculares. Após o lançamento público da estrutura, o relatório de validação torna-se parte do arquivo público do PDB. As pontuações de qualidade geométrica para proteínas no arquivo do PDB melhoraram na última década.
Gore et al. (Qui,) estudaram esta questão.