Usando PyMOL como uma plataforma para design de medicamentos computacional

PyMOL, uma ferramenta de gráficos moleculares multiplataforma, tem sido amplamente utilizada para visualização tridimensional (3D) de proteínas, ácidos nucleicos, pequenas moléculas, densidades eletrônicas, superfícies e trajetórias. Também é capaz de editar moléculas, traçar raios e fazer filmes. Este software baseado em Python, junto com muitas ferramentas de plugin em Python, foi desenvolvido para aumentar suas utilidades e facilitar o design de medicamentos no PyMOL. Para obter uma visão perspicaz das ferramentas úteis de design de medicamentos e suas funções no PyMOL, apresentamos uma discussão extensa sobre vários módulos de modelagem molecular no PyMOL, abrangendo aqueles para aprimoramento de visualização e análise, modelagem proteína-ligante, simulações moleculares e triagem de medicamentos. Esta revisão oferece uma excelente introdução à visualização de estruturas 3D e ao design de medicamentos computacional no PyMOL. WIREs Comput Mol Sci 2017, 7:e1298. doi: 10.1002/wcms.1298 Este artigo é categorizado sob: Estrutura e Mecanismo > Estruturas Moleculares Ciência da Computação e Informação > Visualização Mecânica Molecular e Estatística > Mecânica Molecular