ProThermDB: banco de dados termodinâmico para proteínas e mutantes revisitado após 15 anos

Resumo ProThermDB é uma versão atualizada do banco de dados termodinâmico para proteínas e mutantes (ProTherm), que possui ∼31.500 dados sobre estabilidade de proteínas, um aumento de 84% em relação à versão anterior. Contém vários parâmetros termodinâmicos, como temperatura de fusão, energia livre obtida com desnaturação térmica e por desnaturantes, variação de entalpia e variação de capacidade térmica, juntamente com métodos e condições experimentais, sequência, estrutura e informações da literatura. Além disso, a versão atual do banco de dados inclui cerca de 120.000 dados termodinâmicos obtidos para diferentes organismos e linhagens celulares, que são determinados por técnicas de proteômica de alto rendimento recentes usando abordagens de célula inteira. Além disso, fornecemos uma interface gráfica para visualização de mutações em níveis de sequência e estrutura. ProThermDB é interligado com outros bancos de dados relevantes, como PDB, UniProt, PubMed etc. Está disponível gratuitamente em https://web.iitm.ac.in/bioinfo2/prothermdb/index.html sem requisitos de login. Está implementado em Python, HTML e JavaScript, e suporta as versões mais recentes dos principais navegadores, como Firefox, Chrome e Safari.