Propriedades de peptídeos apresentados pelo MHC Classe I que aumentam a imunogenicidade

Os linfócitos T precisam reconhecer peptídeos apresentados nas moléculas de MHC para serem ativados e elicitar suas funções efetoras. Vários estudos demonstram que alguns peptídeos são mais imunogênicos do que outros e, portanto, mais propensos a serem epítopos para linfócitos T. Nosso objetivo foi determinar quais propriedades causam tais diferenças na imunogenicidade. Para isso, coletamos e analisamos um grande conjunto de dados descrevendo a imunogenicidade de peptídeos apresentados em várias moléculas de MHC-I. Duas principais conclusões podem ser extraídas desta análise: Primeiro, em linha com observações anteriores, mostramos que as posições P4-6 de um peptídeo apresentado são mais importantes para a imunogenicidade. Segundo, alguns aminoácidos, especialmente aqueles com cadeias laterais grandes e aromáticas, estão associados à imunogenicidade. Essas informações foram combinadas em um modelo simples que foi utilizado para demonstrar que a imunogenicidade é, até certo ponto, previsível. Este modelo (disponível em http://tools.iedb.org/immunogenicity/) foi validado com dados de dois estudos independentes de descoberta de epítopos. Curiosamente, com este modelo, pudemos mostrar que os linfócitos T estão equipados para reconhecer melhor peptídeos virais do que peptídeos humanos (auto). Após a elucidação bem-sucedida dos diferentes passos na via de apresentação do MHC-I, a identificação de variáveis que influenciam a imunogenicidade será um importante próximo passo na investigação de epítopos de linfócitos T e na nossa compreensão das respostas imunes celulares.