O servidor PASTA para predição de agregação de proteínas

Muitas proteínas diferentes se agregam em fibrilas amiloides caracterizadas por uma estrutura cruzada-beta. Os beta-fios contribuídos por distintas moléculas de proteína geralmente são encontrados em um alinhamento paralelo em registros. Aqui, descrevemos o servidor web para um novo algoritmo, predição de agregação da estrutura amiloide (PASTA), para prever as porções mais propensas à agregação e o emparelhamento inter-molecular correspondente dos beta-fios para uma sequência de entrada dada. O PASTA já foi mostrado para fornecer resultados em excelente concordância com observações experimentais disponíveis, quando testado em proteínas nativamente não dobradas e estruturadas. O servidor web e o código-fonte disponível para download estão acessíveis gratuitamente no URL: http://protein.cribi.unipd.it/pasta/.