Análise Genômica da Família de Genes ERF em Arabidopsis e Arroz

Os genes da família ERF codificam reguladores transcricionais com uma variedade de funções envolvidas nos processos de desenvolvimento e fisiológicos nas plantas. Neste estudo, uma análise computacional abrangente identificou 122 e 139 genes da família ERF em Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) e arroz (Oryza sativa L. subsp. japonica), respectivamente. Uma visão completa dessa família de genes em Arabidopsis é apresentada, incluindo as estruturas dos genes, filogenia, localizações cromossômicas e motivos conservados. Além disso, foi realizada uma análise comparativa entre esses genes em Arabidopsis e arroz. Como resultado dessas análises, as famílias ERF em Arabidopsis e arroz foram divididas em 12 e 15 grupos, respectivamente, e vários desses grupos foram ainda divididos em subgrupos. Com base na observação de que 11 desses grupos estavam presentes tanto em Arabidopsis quanto em arroz, concluiu-se que a principal diversificação funcional dentro da família ERF precedeu a divergência entre monocotiledôneas e dicotiledôneas. Em contraste, alguns grupos/subgrupos são específicos de espécies. Discutimos a relação entre a estrutura e a função das proteínas da família ERF com base nesses resultados e informações publicadas. Concluiu-se ainda que a expansão da família ERF nas plantas pode ter ocorrido devido à duplicação cromossômica/segmentar e à duplicação em tandem, assim como a transposição e localizações mais antigas. Esses resultados serão úteis para futuras análises funcionais dos genes da família ERF.