CACHE (Avaliação Crítica de Experimentos Computacionais de Busca de Alvos): Uma iniciativa de benchmarking de parceria público-privada para possibilitar o desenvolvimento de métodos computacionais para busca de alvos

Um objetivo aspiracional da química computacional é prever ligantes potentes e semelhantes a fármacos para qualquer proteína, de modo que apenas aqueles que se ligam sejam sintetizados. Neste roteiro, descrevemos o lançamento da Avaliação Crítica de Experimentos Computacionais de Busca de Alvos (CACHE), um projeto público de benchmarking para comparar e melhorar algoritmos de busca de alvos de pequenas moléculas através de ciclos de previsão e teste experimental. Os participantes preverão ligantes de pequenas moléculas para novos alvos proteicos biologicamente relevantes, representando diferentes cenários de previsão. Compostos previstos serão rigorosamente testados em um centro experimental, e todos os ligantes previstos, bem como todos os dados de triagem experimental, incluindo as estruturas químicas dos compostos testados experimentalmente, serão disponibilizados publicamente e não estarão sujeitos a restrições de propriedade intelectual. A capacidade de uma variedade de abordagens computacionais para encontrar novos ligantes será avaliada, comparada e publicada abertamente. O CACHE lançará 3 novos exercícios de benchmarking a cada ano. Os resultados serão melhores métodos de previsão, novos ligantes de pequenas moléculas para proteínas-alvo importantes para biologia fundamental ou descoberta de fármacos, e um grande passo tecnológico em direção ao objetivo do Target 2035, uma iniciativa global para identificar sondas farmacológicas para todas as proteínas humanas.