Análise do transcriptoma e prognóstico dos isoformas ALDH no câncer humano

A superexpressão de ALDH está associada a características semelhantes a células-tronco cancerígenas e a um mau prognóstico do câncer. Alta atividade de ALDH foi observada em células-tronco semelhantes a câncer. Existem um total de 19 isoformas ALDH humanas, todas associadas à redução do estresse oxidativo e proteção das células contra danos. No entanto, não se sabe se todas as ALDHs estão associadas a um mau prognóstico do câncer e quais desempenham um papel significativo na progressão do câncer. Neste estudo, utilizamos dados de sequenciamento de RNA do The Cancer Genome Atlas (TCGA) para avaliar a expressão diferencial de 19 isoformas ALDH em 5 cânceres humanos comuns. Os 19 genes ALDH foram analisados por meio de uma meta-análise integrada do prognóstico do câncer. Genotipagem e sequenciamento de RNA de próxima geração para 30 amostras pareadas de carcinoma espinocelular da cabeça e pescoço foram realizados e comparados com a coorte do TCGA. A análise mostrou que cada isoforma ALDH tinha um padrão específico de expressão diferencial, a maioria dos quais estava relacionada ao prognóstico no câncer humano. Uma expressão mais baixa de ALDH2 no tumor foi observada, o que foi independente da variante SNP rs671 de ALDH2 e da expressão de outros genes codificadores de proteínas associadas a mitocôndrias. Este estudo fornece novas perspectivas sobre a associação entre a expressão de ALDH e o prognóstico do câncer.