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A evolução dos vertebrados foi moldada por várias rodadas de duplicações do genoma completo (WGD) que são frequentemente sugeridas como associadas a radiações adaptativas e inovações evolutivas. Devido a uma rodada adicional de WGD, o genoma da truta arco-íris oferece uma oportunidade única para investigar o destino evolutivo inicial de um genoma de vertebrado duplicado. Aqui mostramos que, após 100 milhões de anos de evolução, os dois subgenomas ancestrais permaneceram extremamente colineares, apesar da perda de metade dos genes codificadores de proteínas duplicados, principalmente por meio da pseudogenização. Em contraste marcante, está o destino dos genes de miRNA que quase todos foram retidos como cópias duplicadas. O lento e gradual processo de rediploidação caracterizado aqui desafia a hipótese atual de que a WGD é seguida por reorganizações genômicas massivas e rápidas e exclusões de genes.
Berthelot et al. (Terça-feira,) estudaram essa questão.