A Filogenômica Revela Casos Claros de Classificação Incorreta e Marcadores Filogenéticos em Larga Escala para Acinetobacter

O gênero Acinetobacter, que é Gram-negativo, possui várias espécies de clara relevância médica. Muitos genomas totalmente sequenciados pertencentes ao gênero foram publicados nos últimos anos; no entanto, não houve uma tentativa recente de inferir a história evolutiva de Acinetobacter com essa vasta quantidade de informações. Aqui, por meio de uma abordagem filogenômica, estabelecemos a visão mais atualizada das relações evolutivas dentro deste gênero e destacamos vários casos de classificação inadequada, especialmente para as espécies muito próximas dentro do complexo Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii (complexo Acb). Além disso, determinamos marcadores filogenéticos apropriados para este gênero e mostramos que a concatenação dos 13 principais fornece uma reflexão bastante precisa das relações evolutivas para o gênero Acinetobacter. A interseção entre nossos principais marcadores e marcadores universais previamente definidos é muito pequena. Em geral, nosso estudo demonstra que, embora pareça não haver marcadores universais, abordagens filogenômicas personalizadas podem ser utilizadas para inferir a filogenia de diferentes gêneros bacterianos. Esperamos que abordagens filogenômicas ad hoc se tornem o padrão nos próximos anos e forneçam informações suficientes para resolver intricadas relações evolutivas como as observadas no complexo Acb.