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Apesar de seu uso de códon mal adaptado, o HIV-1 se replica e é expresso extremamente bem nas células hospedeiras humanas. Recentemente, foi demonstrado que o HIV-1 embala RNAs transferentes (tRNAs) não lisílicos, além do tRNA(Lys) necessário para a ativação da transcrição reversa e integração do genoma do HIV-1. Ao comparar o uso do códon dos genes do HIV-1 com o de seu hospedeiro humano, encontramos que os tRNAs que decodificam códon que são altamente utilizados pelo HIV-1, mas evitados por seu hospedeiro, estão sobre-representados nos virions do HIV-1. Em particular, os tRNAs que decodificam códon que terminam em A, necessários para a expressão do genoma rico em A do HIV, estão altamente enriquecidos. Como a afinidade de Gag-Pol por todos os tRNAs é não específica, o empacotamento do HIV é provavelmente passivo e reflete o pool de tRNA no momento da formação da partícula viral. O uso de códon dos genes iniciais do HIV-1 é semelhante ao de genes do hospedeiro altamente expressos, mas o uso de códon dos genes tardios do HIV-1 foi melhor adaptado ao pool de tRNA seletivamente enriquecido, sugerindo que alterações no pool de tRNA são induzidas tardiamente na infecção viral. Se os genes do HIV-1 estão se adaptando a um pool de tRNA alterado, a adaptação do códon do HIV-1 pode ser melhor do que se pensava anteriormente.
Weringh et al. (Fri,) estudaram essa questão.
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