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Os carboidratos complexos da biomassa terrestre e marinha representam uma rica fonte de nutrientes para micróbios livres e mutualísticos. A sacarificação enzimática desses diversos substratos é de importância crítica para alimentar uma variedade de comunidades microbianas complexas, incluindo microbiotas marinhas, de solo, ruminantes e monogástricos. Consequentemente, enzimas ativas em carboidratos, proteínas de reconhecimento e transportadores altamente específicos são enriquecidos nos genomas de certas espécies e são de importância crítica em ambientes competitivos. Em bactérias do grupo Bacteroidetes, esses sistemas estão organizados como locais de utilização de polissacarídeos (PULs), que são clusters gênicos estritamente regulados e colocalizados que codificam conjuntos de enzimas e proteínas necessários para a sacarificação de carboidratos complexos. Esta revisão fornece perspectivas históricas e resume descobertas-chave no estudo desses sistemas, destacando uma mudança crítica da descoberta de PULs baseada em sequência para análises baseadas em sistemas que combinam genética reversa, bioquímica, enzimologia e biologia estrutural para iluminar precisamente os mecanismos moleculares que sustentam a função dos PULs. As implicações ecológicas do uso dinâmico de PULs por espécies-chave no trato gastrointestinal humano são exploradas, assim como a distribuição mais ampla desses sistemas em outros ambientes intestinais, terrestres e marinhos.
Grondin et al. (Ter,) estudaram essa questão.