A estrutura genética da população turca revela altos níveis de variação e mistura

A construção de variomas baseados em populações contribuiu substancialmente para a nossa compreensão da base genética das doenças hereditárias humanas. Aqui, investigamos a estrutura genética da Turquia a partir de 3.362 indivíduos não relacionados, cujos exomas completos (n = 2.589) ou genomas completos (n = 773) foram sequenciados para gerar um Varioma Turco (TR) que deve servir para facilitar a descoberta de genes da doença na Turquia. Consistente com a história da Turquia atual como um cruzamento entre a Europa e a Ásia, encontramos extensa mistura entre populações dos Bálcãs, do Cáucaso, do Oriente Médio e da Europa, com uma relação genética mais próxima da população TR em relação aos europeus do que se apreciou anteriormente. Determinamos que 50% dos indivíduos TR apresentavam altos coeficientes de endogamia (≥0,0156), com segmentos de homozigose superiores a 4 Mb encontrados exclusivamente na população TR em comparação com as populações do Projeto 1000 Genomas. Também encontramos que 28% das variantes do exoma e 49% das variantes do genoma na faixa muito rara (frequência de alelos < 0,005) são exclusivas da moderna população TR. Anotamos essas variantes com base em suas consequências funcionais para estabelecer um Varioma TR contendo alelos de relevância médica potencial, um repositório de variantes homozigotas perda de função e um painel de referência TR para imputação de genótipo usando haplótipos de alta qualidade, para facilitar estudos de associação em todo o genoma. Além de fornecer informações sobre a estrutura genética da moderna população TR, esses dados oferecem um recurso inestimável para estudos futuros que identifiquem variantes associadas a fenótipos específicos, bem como para estabelecer as consequências fenotípicas de mutações em genes específicos.