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A família UbiD de (des)carboxilases reversíveis depende do cofator de FMN prenilado (prFMN) recentemente descoberto para a atividade. A enzima modelo descarboxilase do ácido ferúlico (Fdc1) descarboxila ácidos alifáticos insaturados por meio de um processo reversível de 1,3-cicloadição. A engenharia de proteínas expandiu a faixa de substratos da Fdc1 para incluir ácidos (hetero)aromáticos, embora as taxas catalíticas permaneçam baixas. Isso levanta a questão de quão eficiente a descarboxilação de ácidos (hetero)aromáticos é alcançada por outros membros da família UbiD. Aqui, mostramos que o fator de atenuação da virulência da Pseudomonas aeruginosa PA0254/HudA é uma descarboxilase do ácido pirrole-2-carboxílico. A estrutura cristalina da enzima na presença do inibidor reversível imidazol revela que um aduto covalente de prFMN-imidazol é formado. A triagem de substratos revela que HudA e variantes selecionadas do sítio ativo podem aceitar uma faixa modesta de compostos heteroaromáticos, incluindo ácido tiolfeno-2-carboxílico. Juntamente com estudos computacionais, nossos dados sugerem que a catálise covalente de prFMN ocorre por meio de substituição eletrofílica aromática e liga a atividade de HudA aos efeitos inibitórios do ácido pirrole-2-carboxílico na comunicação quórum de P. aeruginosa.
Payne et al. (Quarta,) estudaram essa questão.