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Os dados de proteômica shotgun são afetados por uma variedade de vieses sistemáticos conhecidos e desconhecidos, bem como altas proporções de valores ausentes. Normalmente, a normalização é realizada na tentativa de remover vieses sistemáticos dos dados antes da inferência estatística, às vezes seguida pela imputação de valores ausentes para obter uma matriz completa de intensidades. Aqui discutimos várias abordagens para normalização e tratamento de valores ausentes, algumas inicialmente desenvolvidas para dados de microarrays e algumas desenvolvidas especificamente para dados baseados em espectrometria de massas.
Karpievitch et al. (Thu,) estudaram essa questão.
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