• Neurospora crassa tem menor redundância de genes metabólicos de açúcar do que Aspergillus niger • O tipo de acasalamento de N. crassa afeta o crescimento de cepas de deleção metabólica de açúcar • Apresentamos um modelo metabólico de açúcar para N. crassa fortemente aprimorado O fungo filamentosos Neurospora crassa tem sido um organismo modelo para compreender muitos aspectos fundamentais da biologia eucariota. Aqui, construímos um modelo em escala genômica de seu metabolismo de açúcar com base no modelo metabólico de açúcar de Aspergillus niger usando uma abordagem baseada em ortologia. Para suportar ainda mais o modelo, o papel dos genes identificados em vias específicas foi validado avaliando sua expressão em dados de transcriptoma de N. crassa de estudos publicados anteriormente durante o crescimento em diferentes fontes de carbono e pelos fenótipos de crescimento de mutantes de deleção para genes selecionados. Esses dados foram comparados com outra espécie modelo de Sordariomycete (Trichoderma reesei) e o ascomiceto A. niger. Os modelos metabólicos de açúcar baseados em genoma e ortologia revelaram que N. crassa tem alta similaridade com T. reesei em nível genômico, mas uma menor redundância gênica para etapas individuais da via do que A. niger. Isso foi confirmado pela redução significativa do crescimento de cepas nas quais um único gene para uma etapa da via foi deletado, enquanto estudos anteriores em A. niger frequentemente exigiam a deleção de múltiplos genes para obter redução significativa no crescimento. Curiosamente, houve maior similaridade nos perfis de transcriptoma de genes ortólogos de T. reesei e A. niger, enquanto em N. crassa, perfis diferentes foram observados para genes de várias vias. Este estudo fornece uma estrutura bem suportada para estudos metabólicos em N. crassa e exemplifica a modificação específica da espécie que ocorre na organização do metabolismo de açúcar em fungos filamentosos.
Li et al. (Quarta-feira) estudaram essa questão.