Diversidade genética preservada em organoides cultivados a partir de biópsias de metástases de câncer colorretal humano

Organoides tumorais são culturas 3D de células cancerígenas. Eles podem ser derivados do tumor de cada paciente individual, proporcionando assim um ensaio ex vivo atrativo para personalizar o tratamento. Utilizar organoides tumorais derivados de pacientes para esse propósito requer que os organoides originados de biópsias mantenham a diversidade genética do tumor in vivo. Neste estudo, biópsias tumorais foram obtidas de 14 pacientes com câncer colorretal metastático (i) para testar a viabilidade do cultivo de organoides a partir de espécimes de biópsia metastática e (ii) para comparar a diversidade genética de organoides tumorais derivados de pacientes e a biópsia tumoral original. A análise genética foi realizada usando sequenciamento SOLiD para 1.977 genes relevantes para o câncer. Perfis de número de cópias foram gerados a partir de dados de sequenciamento usando CopywriteR. Aqui demonstramos que culturas de organoides podem ser estabelecidas a partir de biópsias de pacientes com câncer colorretal metastático com uma taxa de sucesso de 71%. A análise genética mostrou que os organoides refletem a metástase da qual foram derivados. Noventa por cento das mutações somáticas eram compartilhadas entre organoides e biópsias do mesmo paciente, e os perfis de número de cópias de DNA dos organoides e do tumor original correspondente mostram uma correlação de 0,89. Mais importante, nenhuma das mutações que foram encontradas exclusivamente no tumor ou na cultura de organoides está em genes impulsores ou em genes passíveis de direcionamento para medicamentos. Esses achados apoiam uma exploração mais aprofundada de organoides derivados de pacientes como uma plataforma ex vivo para personalizar o tratamento anticâncer.