Efeitos do cultivo líquido na expressão gênica e fenótipo de C. elegans

FUNDAMENTOS: de volta às placas de ágar. RESULTADOS: Variações significativas foram encontradas nas expressões gênicas entre as linhagens N2 e AB1 em resposta ao cultivo líquido. Os resultados demonstraram que 8-34% das respostas transcricionais induzidas pela mudança ambiental são transmitidas para a geração subsequente. Ao categorizar as expressões gênicas por genótipo, ambiente e interações genótipo-ambiente, identificamos que o genótipo tem um impacto substancial nas respostas adaptativas. A análise funcional do transcriptoma mostrou correlação com mudanças fenotípicas. Por exemplo, a linhagem N2 exibiu alterações tanto no fenótipo quanto nas expressões gênicas para linhagem germinativa e cutícula no cultivo líquido axênico. Encontramos evidências de transcritos para aproximadamente 21% dos genes preditos computacionalmente em C. elegans ao expor os vermes a mudanças ambientais. CONCLUSÕES: O estudo apresentado revela diferenças substanciais entre as linhagens N2 e AB1 nas respostas transcriptômicas e fenotípicas a rápidas mudanças ambientais. Nossos dados podem fornecer controles padrão para estudos futuros sobre o cultivo líquido de C. elegans e possibilitar a descoberta de genes específicos de condições.