Polimorfismo do DNA Detectável por Endonucleases de Restrição

Dados sobre polimorfismos de DNA detectados por endonucleases de restrição estão se acumulando rapidamente. Com o objetivo de analisar esses dados, várias medições diferentes de diversidade nucleotídica (segmento de DNA) dentro e entre populações são propostas, e métodos estatísticos para estimar essas quantidades são desenvolvidos. Esses métodos estatísticos são aplicáveis tanto a DNAs nucleares quanto a não nucleares. Quando a mudança evolutiva dos nucleotídeos ocorre principalmente por mutação e deriva genética, todas as medidas podem ser expressas em termos do produto da taxa de mutação por nucleotídeo e do tamanho efetivo da população. Um método para estimar a diversidade de nucleotídeos a partir da diversidade de nucleotídeos também é apresentado sob certas suposições. Mostra-se que a divergência do DNA entre duas populações pode ser estudada tanto pelo número médio de diferenças nos locais de restrição quanto pelo número médio de diferenças nos nucleotídeos. Em qualquer um dos casos, um grande número de diferentes enzimas de restrição deve ser utilizado para estudar as relações filogenéticas entre organismos relacionados, uma vez que o efeito de fatores estocásticos sobre essas quantidades é muito grande. Os métodos estatísticos desenvolvidos foram aplicados a dados de Shah e Langley sobre DNA mitocondrial (mtDNA) de Drosophila melanogaster, simulans e virilis. Essa aplicação sugeriu que a mudança evolutiva do mtDNA em animais superiores ocorre principalmente por substituição de nucleotídeos em vez de deleção e inserção. As distâncias evolutivas entre as três espécies também foram estimadas.