Sequenciamento de Alta Vazão Revela a Recuperação Incompleta e de Curto Prazo da Microbiota Intestinal de Lactentes Após Tratamento Antibiótico Parenteral com Ampicilina e Gentamicina

A microbiota intestinal de lactentes passa por mudanças dramáticas durante os primeiros 2 anos de vida. A aquisição e desenvolvimento dessa população podem ser influenciados por numerosos fatores, e o tratamento com antibióticos foi sugerido como um dos mais significativos. No entanto, apesar disso, houve relativamente poucos estudos que investigaram a recuperação de curto prazo da microbiota intestinal de lactentes após o tratamento com antibióticos. O objetivo deste estudo foi utilizar sequenciamento de alta vazão (empregando primers específicos para 16S rRNA e rpoB) e PCR quantitativa para comparar a microbiota intestinal de nove lactentes que receberam tratamento antibiótico parenteral com ampicilina e gentamicina (dentro de 48 h após o nascimento), 4 e 8 semanas após a conclusão do tratamento, em relação à de nove controles saudáveis pareados. A investigação revelou que a microbiota intestinal dos lactentes tratados com antibióticos tinha proporções significativamente mais altas de Proteobacteria (P = 0.0049) e proporções significativamente mais baixas de Actinobacteria (P = 0.00001) (e o gênero associado Bifidobacterium P = 0.0132), bem como o gênero Lactobacillus (P = 0.0182), do que os controles não tratados 4 semanas após a interrupção do tratamento. Na semana 8, os níveis de Proteobacteria permaneceram significativamente mais altos nos lactentes tratados (P = 0.0049), mas os níveis de Actinobacteria, Bifidobacterium e Lactobacillus tinham se recuperado e eram semelhantes aos das amostras de controle. Apesar dessa recuperação no número total de Bifidobacterium, o sequenciamento por pirosequenciamento direcionado ao rpoB revelou que o número de diferentes espécies de Bifidobacterium presentes nos lactentes tratados com antibióticos foi reduzido. Assim, é aparente que o uso combinado de ampicilina e gentamicina na infância pode ter efeitos significativos na evolução da microbiota intestinal de lactentes, cujas implicações para a saúde a longo prazo permanecem desconhecidas.