Métodos de RNA-seq de célula única para investigar interações vírus-hospedeiro

O século XXI viu o surgimento de muitos vírus epidêmicos e pandêmicos, sendo o mais recente a pandemia de COVID-19 induzida pelo SARS-CoV-2. Como parasitas intracelulares obrigatórios, os vírus dependem de células hospedeiras para se replicar e produzir prole, resultando em dinâmicas complexas entre vírus e hospedeiro durante uma infecção. O sequenciamento de RNA de célula única (scRNA-seq), ao permitir o perfilamento amplo e simultâneo de transcritos tanto de hospedeiros quanto de vírus, representa uma tecnologia poderosa para desvendar o delicado equilíbrio entre hospedeiro e vírus. Nesta revisão, resumimos os avanços tecnológicos e metodológicos em scRNA-seq e suas aplicações na imunidade antiviral. Destacamos aplicações-chave de scRNA-seq que possibilitaram a compreensão da heterogeneidade da resposta genômica viral e do hospedeiro, respostas diferenciais de células infectadas versus células vizinhas, e redes de comunicação intercelular. Esperamos que o desenvolvimento adicional das tecnologias de scRNA-seq e métodos analíticos, combinado com medições de modalidades multi-ômicas adicionais e a maior disponibilidade de conjuntos de dados de scRNA-seq acessíveis publicamente, permita uma melhor compreensão da patogênese viral e melhore o desenvolvimento de estratégias terapêuticas antivirais.