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Muitas das hipóteses baseadas na observação inicial de que TFIIIA possui uma estrutura aproximadamente periódica com pares invariantes de cisteínas e histidinas aparentemente capazes de coordenar íons metálicos estão claramente corretas. Um número surpreendente de outros clones de cDNA codifica proteínas que contêm uma ou mais sequências que correspondem ao consenso de dedo de zinco, revelando que as proteínas de dedo de zinco representam talvez a maior classe de proteínas ligantes de DNA em eucariotos e que a expressão gênica controlada por proteínas de dedo de zinco pode ser um aspecto fundamental do desenvolvimento, assim como de outros processos. Um grande progresso foi feito na elucidação da estrutura de domínios de dedo de zinco únicos. A partir do conhecimento dessas estruturas, modelos plausíveis e testáveis podem ser desenvolvidos para os complexos entre proteínas de dedo de zinco e seus locais de ligação ao DNA. Claramente, um dos desafios mais importantes restantes nesta área envolve testar e estender esses modelos. Dados estruturais sobre tais complexos proteína-ácido nucleico derivados de estudos de RMN ou cristalográficos são tremendamente valiosos a este respeito. Finalmente, uma questão fundamental adicional é levantada pela observação de que esta família e outras importantes proteínas ligantes de ácidos nucleicos contêm íons de zinco ligados em pequenos domínios estruturais. A ligação de zinco é meramente uma estratégia estrutural útil para gerar domínios envolvidos em interações macromoleculares, ou flutuações na concentração de zinco são utilizadas de alguma forma para regular a expressão gênica? Os dados biofísicos disponíveis até o momento certamente não descartam essa possibilidade intrigante.
Jeremy M Berg (Sex,) estudou essa questão.