Microbiota do intestino delgado em crianças zambianas com atraso de crescimento e desnutrição aguda severa

A desnutrição infantil está ligada a mudanças no microbioma intestinal; no entanto, a maioria dos estudos foca em amostras fecais, enquanto se sabe menos sobre o microbioma do intestino delgado. Aqui, caracterizamos a microbiota duodenal de crianças na Zâmbia com desnutrição aguda severa (DAS) e atraso de crescimento e comparamos os microbiomas de crianças com atraso de crescimento que vivem ao redor do mundo. Para isso, aspirados duodenais de apenas crianças com atraso de crescimento (ou seja, não simultaneamente em estado de emagrecimento) (n = 53) e DAS (n = 24) da Zâmbia foram analisados por sequenciamento de amplicons do gene 16S rRNA. Associações entre composição bacteriana, características clínicas e biomarcadores de enteropatia foram exploradas. A comparação de conjuntos de dados do gene 16S rRNA duodenal de crianças desnutridas em diferentes países também foi realizada utilizando conjuntos de dados publicamente disponíveis para avaliar o impacto da idade e da geografia na diversidade e composição microbiana. A microbiota duodenal de crianças tanto com atraso de crescimento quanto com DAS foi dominada por Streptococcus, Granulicatella, Gemella e Klebsiella. Crianças com DAS apresentaram menor α-diversidade em comparação às crianças com atraso de crescimento. A meta-análise revelou semelhanças na composição bacteriana de crianças pareadas por idade em diferentes países, mas as abundâncias relativas e sua associação com o estado nutricional diferiram. Este estudo oferece insights sobre a microbiota duodenal em crianças com diferentes estados de desnutrição, destacando a influência potencial da geografia e da idade na formação do intestino delgado proximal. Este artigo faz parte da edição temática 'Fatores biológicos, biomédicos e ambientais do atraso de crescimento'.