Semelhança Química Usando Descritores de Propriedades Fisicoquímicas

As buscas por similaridade utilizando descritores topológicos têm se mostrado extremamente úteis para auxiliar na triagem em larga escala. Descrevemos formas alternativas dos pares de átomos (Carhart et al. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1985, 25, 64−73.) e da torção topológica (Nilakantan et al. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1987, 27, 82−85.) que usam tipos de átomos fisicoquímicos. Esses tipos são baseados na classe de propriedades de ligação, na contribuição do log P atômico e nas cargas atômicas parciais. Os novos descritores têm como objetivo serem mais "fuzzy" do que os descritores originais. Propomos critérios objetivos para determinar quão eficaz um descritor é em comparação a outro na seleção de compostos ativos a partir de grandes bancos de dados. Usando esses critérios, realizamos buscas por similaridade no Derwent Standard Drug File com dez sondas típicas de fármacos. Os novos descritores não são tão bons quanto os descritores originais na seleção de ativos se considerarmos a média sobre todas as sondas, mas os novos descritores se saem melhor em várias sondas individuais. Geralmente, constatamos que se um descritor se sai melhor do que outro varia de sonda para sonda de uma forma quase impossível de prever a priori. Mais importante, descobrimos que diferentes descritores tipicamente selecionam conjuntos de ativos muito diferentes. Assim, é vantajoso realizar sondas de similaridade com vários tipos de descritores.