DIANA-miTED: um banco de dados de expressão de microRNA em tecidos

microARNs (miARNs) são curtos (∼23nt) RNAs não codificantes de fita simples que atuam como potentes reguladores da expressão gênica pós-transcricional. A informação sobre a expressão e distribuição de miARNs entre tipos celulares e tecidos é crucial para a compreensão de sua função e para seu uso translacional como biomarcadores ou alvos terapêuticos. DIANA-miTED é a coleção mais abrangente e sistemática de valores de expressão de miARNs, derivada da análise de 15.183 conjuntos de dados de RNA pequeno humano (sRNA-Seq) do Sequence Read Archive (SRA) e do The Cancer Genome Atlas (TCGA). A qualidade dos metadados maximiza a utilidade dos atlas de expressão, portanto, nós curamos manualmente as informações derivadas do SRA e do TCGA para entregar um conjunto abrangente e padronizado, incorporando no total 199 tecidos, 82 sublocais anatômicos, 267 linhagens celulares e 261 doenças. miTED oferece visualizações instantâneas ricas da expressão e das distribuições de amostras dos dados solicitados entre variáveis, bem como diagramas e gráficos abrangentes que permitem uma exploração eficiente do conteúdo. As consultas também geram links para recursos funcionais de miARN de última geração, tornando miTED um ponto de partida ideal para recuperação, exploração, comparação e análise subsequente de expressão, sem exigir suporte ou expertise em bioinformática. DIANA-miTED está disponível gratuitamente em http://www.microrna.gr/mited.