Caracterização cinética e filogenética de uma comunidade microbiana anaeróbica descloradora

A descloração redutiva (RD) do tetracloroeteno (PCE) para cloreto de vinila (VC) e, em menor extensão, para eteno (ETH) por uma comunidade microbiana anaeróbica foi investigada através do estudo dos processos e cinéticas dos principais componentes fisiológicos do consórcio. O hidrogênio molecular, produzido por acetógenos que utilizam metanol, foi o doador de elétrons para a RD de PCE a VC e ETH sem formar quantidades apreciáveis de outros intermediários clorados e na quase ausência de atividade metanogênica. A estrutura da comunidade microbiana do consórcio foi investigada por meio da preparação de uma biblioteca de clones de 16S rDNA e pela hibridação in situ por fluorescência (FISH). Os iniciadores de PCR usados na biblioteca de clones permitiram a colheita de 16S rDNA de membros bacterianos e arqueais da comunidade. Um total de 616 clones foi selecionado por análise de RFLP dos inserções de clones seguido pelo sequenciamento dos representantes de grupos RFLP e análise filogenética. A biblioteca de clones continha sequências principalmente de bactérias até então não descritas. Nenhuma sequência similar às das bactérias RD conhecidas, como 'Dehalococcoides ethenogenes' ou Dehalobacter restrictus, foi encontrada na biblioteca de clones, e nenhuma dessas bactérias estava presente no consórcio RD de acordo com FISH. Quase todos os clones se enquadraram em seis filos previamente descritos do domínio bacteriano, com a maioria (56,6 %) sendo membros de ramificação profunda do filo Spirochaetes. Outros clones estavam no filo Firmicutes (18,5 %), no filo Chloroflexi (16,4 %), no filo Bacteroidetes (6,3 %), no gênero Synergistes (1,1 %) e numa linhagem que não pôde ser afiliada a filos existentes (1,1 %). Nenhum clone arqueal foi encontrado na biblioteca de clones. Devido à novidade filogenética da comunidade microbiana em relação a microrganismos cultivados anteriormente, nenhum componente microbiano específico pôde ser hipoteticamente afiliado ao fenótipo RD. A predominância de Spirochaetes no consórcio microbiano, o principal grupo revelado pela análise da biblioteca de clones, foi confirmada por FISH usando uma sonda desenvolvida propositadamente.