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Resumo Este artigo de revisão descreve a co-evolução da biologia estrutural como uma disciplina e o Banco de Dados de Proteínas (PDB), estabelecido em 1971 como o primeiro recurso de dados de acesso aberto em biologia por cientistas estruturais de ideias afins. À medida que o arquivo do PDB cresceu em tamanho e escopo para abranger cristalografia de macromoléculas, espectroscopia de RMN e microscopia eletrônica criogênica, novas tecnologias foram desenvolvidas para ingerir, validar, curar, armazenar e distribuir as informações. O engajamento da comunidade garantiu que as necessidades dos biólogos estruturais (depositantes de dados) e dos consumidores de dados fossem atendidas. Hoje, o arquivo abriga mais de 230.000 estruturas determinadas experimentalmente de proteínas, ácidos nucleicos e máquinas macromoleculares e seus complexos entre si e com ligantes de pequenas moléculas. Os custos agregados de preservação de dados do PDB são de aproximadamente 1% do custo de determinação de estruturas. O enorme impacto dos dados do PDB na pesquisa básica e aplicada e na educação nas ciências naturais e médicas é apresentado e destacado com exemplos ilustrativos. A possibilidade de previsão de estrutura de proteína de novo (AlphaFold2, RoseTTAfold, OpenFold, etc.) é o benefício mais amplamente apreciado de ter um corpus de dados de biostruturas 3D rigorosamente validados e curados por especialistas.
Berman et al. (Quarta-feira,) estudaram essa questão.