PDBe: melhoria da encontrabilidade dos dados de estrutura macromolecular no PDB

O Banco de Dados de Proteínas na Europa (PDBe), um membro fundador do Banco de Dados de Proteínas Mundial (wwPDB), participa ativamente da deposição, curadoria, validação, arquivamento e disseminação de dados de estrutura macromolecular. O PDBe apoia diversas comunidades de pesquisa no uso de estruturas macromoleculares, enriquecendo os dados do PDB e oferecendo ferramentas e serviços avançados para acesso, visualização e análise eficazes de dados. Este artigo detalha o enriquecimento de dados no PDBe, incluindo a mapeamento de estruturas de RNA para Rfam e a identificação de moléculas que atuam como cofatores. O PDBe desenvolveu uma instalação de busca avançada com ∼100 categorias de dados e buscas por sequência. Novos recursos foram incluídos no visualizador LiteMol no PDBe, com visualização atualizada de carboidratos e ácidos nucleicos. Pequenas moléculas agora estão mapeadas de forma mais extensa para bancos de dados externos e sua representação visual foi aprimorada. Esses avanços ajudam os usuários a encontrar e interpretar mais facilmente dados de estrutura macromolecular para resolver problemas científicos.