Banco de Dados de Proteínas do Japão (PDBj): mantendo um arquivo de dados estruturais e um formato de estrutura de descrição de recursos

O Banco de Dados de Proteínas do Japão (PDBj, http://pdbj.org) é um membro do Banco de Dados de Proteínas mundial (wwPDB) e aceita e processa os dados depositados de estruturas macromoleculares determinadas experimentalmente. Enquanto mantém o arquivo em colaboração com outros parceiros do wwPDB, o PDBj também fornece uma ampla gama de serviços e ferramentas para analisar estruturas e funções das proteínas, que são resumidas neste artigo. Para melhorar a interoperabilidade dos dados do PDB, desenvolvemos recentemente o PDB/RDF, dados do PDB no formato de Framework de Descrição de Recursos (RDF), juntamente com sua ontologia na Linguagem de Ontologia da Web (OWL) baseada no Dicionário de Troca mmCIF do PDB. Estando no formato padrão para a Web Semântica, os dados do PDB/RDF fornecem um meio para integrar o PDB com outros recursos de informação biológica.