JASPAR: um banco de dados de acesso aberto para perfis de ligação de fatores de transcrição eucarióticos

A análise de regiões regulatórias em sequências genômicas baseia-se fortemente na detecção de potenciais locais de ligação de fatores de transcrição. Os modelos preferidos para representação da especificidade de ligação de fatores de transcrição foram chamados de matrizes de pontuação específicas para posição. JASPAR é um banco de dados de acesso aberto de perfis de locais de ligação de fatores de transcrição anotados, de alta qualidade e baseados em matrizes para eucarióticos multicelulares. Os perfis foram derivados exclusivamente de conjuntos de sequências nucleotídicas que foram experimentalmente demonstradas para ligarem-se a fatores de transcrição. O banco de dados é complementado por uma interface web para navegação, pesquisa e seleção de subconjuntos, uma utilidade de análise de sequência online e um conjunto de ferramentas de programação para análise genômica abrangente e comparativa de regiões regulatórias. JASPAR está disponível em http://jaspar.cgb.ki.se.