A Linguagem Aberta de Biologia Sintética (SBOL) Versão 3: Troca de Dados Simplificada para Bioengenharia

A Linguagem Aberta de Biologia Sintética (SBOL) é um padrão de dados desenvolvido pela comunidade que permite que o conhecimento sobre designs biológicos seja capturado usando uma representação tratável por máquina, apoiada por ontologia, construída com tecnologias da Web Semântica. Enquanto as versões iniciais do SBOL focavam apenas na descrição de componentes baseados em DNA e seus subcomponentes, o SBOL agora pode ser usado para representar conhecimento em múltiplas escalas e em todo o fluxo de trabalho da biologia sintética, desde a especificação de uma única molécula ou fragmento de DNA até sistemas multicelulares contendo múltiplos circuitos genéticos interativos. A terceira grande iteração do padrão SBOL, SBOL3, é um esforço para simplificar e aprimorar o modelo de dados subjacente com foco em aplicações do mundo real, com base na experiência da implementação do SBOL em uma variedade de ambientes científicos e industriais. Aqui, introduzimos a especificação SBOL3 tanto em comparação com versões anteriores do SBOL quanto por meio de exemplos práticos de seu uso.