Pesquisas em bancos de dados de proteínas para múltiplos alinhamentos.

Pesquisas em bancos de dados de proteínas frequentemente podem revelar relações sequenciais biologicamente significativas úteis na compreensão da estrutura e função. Padrões sequenciais fracos, mas significativos, podem ser obscurecidos, no entanto, por outras semelhanças devido apenas ao acaso. Ao buscar em um banco de dados por múltiplos em vez de alinhamentos pareados, relações distantes são muito mais facilmente distinguidas do ruído de fundo. Resultados estatísticos recentes permitem que o poder dessa abordagem seja analisado. Dada uma sequência de consulta típica, um algoritmo descrito aqui permite que o banco de dados de proteínas atual seja pesquisado para alinhamentos de três sequências em menos de 4 minutos. Essas pesquisas revelaram uma variedade de relações sutis que métodos de busca pareados seriam incapazes de detectar.