Caracterização Molecular em Larga Escala da Integração do Vetor de Vírus Adeno-Associado no Fígado de Camundongos

O vetor de vírus adeno-associado recombinante (rAAV) é promissor para terapia gênica. Apesar da baixa frequência de integração cromossômica dos genomas do vetor, estudos recentes levantaram preocupações sobre o risco de integração do rAAV, uma vez que a integração ocorre preferencialmente em genes e acompanha deleções cromossômicas, o que pode levar à mutagênese insercional de perda de função. Aqui, ao analisar 347 integrações de rAAV em camundongos, elucidamos novas características da integração do rAAV: a presença de locais quentes para integração e uma forte preferência por se integrar perto de sequências reguladoras de genes. O local quente mais proeminente foi um nicho cromossômico inócuo nos repetições do gene rRNA, enquanto quase metade das integrações ocorreram perto de locais de início de transcrição ou ilhas CpG, sugerindo a possibilidade de ativar genes relacionados a doenças celulares adjacentes pela integração do vetor, semelhante à mutagênese insercional de ganho de função retroviral. Genes possivelmente relacionados ao câncer foram afetados pela integração do rAAV em uma frequência de 3,5%. Além disso, as informações sobre mudanças cromossômicas em 218 locais de integração e 602 pontos de ruptura dos genomas do vetor forneceram uma pista de como as repetições terminais do vetor e o DNA cromossômico do hospedeiro são unidos no processo de integração. Assim, o presente estudo fornece novas percepções sobre o risco de mutagênese insercional mediada por rAAV e os mecanismos da integração do rAAV.