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Eventualmente, para entender a função integrada da rede regulatória do ciclo celular, precisamos organizar as interações conhecidas na forma de um diagrama, mapa e/ou banco de dados. Um formato de diagrama foi criado capaz de representar de forma inequívoca redes contendo complexos multiproteicos, modificações de proteínas e enzimas que são substratos de outras enzimas. Para facilitar a ligação a um banco de dados, cada espécie molecular é representada simbolicamente apenas uma vez em cada diagrama. Espécies moleculares podem ser localizadas no mapa por meio de coordenadas de grade indexadas. Cada interação é referenciada a uma lista de anotações onde informações pertinentes e referências podem ser encontradas. Partes da rede são agrupadas em subsistemas funcionais. O mapa mostra como complexos multiproteicos poderiam se montar e funcionar em locais de promotores de genes e em locais de dano ao DNA. Ele também retrata a riqueza de conexões entre o subsistema p53-Mdm2 e outras partes da rede.
Kurt W. Kohn (Sun,) estudou essa questão.
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