Estrutura proposta para os domínios de ligação ao zinco do fator de transcrição IIIA e proteínas relacionadas.

Várias proteínas, incluindo a proteína reguladora de genes fator de transcrição IIIA, demonstraram conter repetições em tandem de sequências de aproximadamente 30 aminoácidos que se acredita formarem domínios estruturais ao redor de íons de zinco ligados ("dedos de zinco"). A sequência consenso para essas repetições é (Phe, Tyr)-Xaa-Cys-(Xaa)2 ou 4-Cys-(Xaa)3-Phe-(Xaa)5-Leu-(Xaa)2-His-(Xaa)3-His-(Xaa)5, onde Xaa é qualquer aminoácido. Comparações com metaloproteínas com estruturas conhecidas permitiram o desenvolvimento de um modelo tridimensional detalhado para esses domínios, consistindo em uma folha beta antiparalela seguida por uma hélice alfa. A estrutura proposta fornece uma base para entender os papéis detalhados dos resíduos conservados e permite a construção de um modelo para a interação dessas proteínas com ácidos nucleicos, nos quais as proteínas se enrolam ao redor dos ácidos nucleicos na grande groove.