Efeitos de rede e efeitos psicológicos: uma teoria do movimento urbano

Uma combinação de técnicas de tipagem de bacteriocina, bacteriófago e plasmídeo foi usada para diferenciar cepas de Clostridium difficile. Um conjunto de tipagem de 20 cepas produtoras de bacteriocina foi estabelecido após 400 isolados de C. difficile terem sido testados quanto à capacidade de produzir bacteriocina. Essas cepas foram usadas para tipar uma coleção de 114 isolados de C. difficile. Quarenta e seis (40%) dos 114 isolados foram tipáveis, e 31 padrões de tipagem foram distinguíveis. A tipagem de plasmídeo dos mesmos 114 isolados de C. difficile mostrou que 67 (59%) dos isolados continham até quatro plasmídeos variando de 7 a 60 kb de tamanho, embora a maioria das cepas contivesse apenas um ou dois plasmídeos. Vinte padrões diferentes de tipagem de plasmídeo foram observados entre os isolados. Uma combinação de tipagem de bacteriocina e plasmídeo forneceu 77% de tipabilidade. Quinze (13%) das 114 cepas foram tipáveis com cinco bacteriófagos isolados em nosso laboratório, mas o aumento na tipabilidade das cepas em relação àquela obtida por tipagem de plasmídeo e bacteriocina foi de apenas 1,8%. Isolados que não eram tipáveis por bacteriocinas, plasmídeos ou fagos podiam ser divididos em dois grupos com base na produção positiva ou negativa de citotoxina. Essa divisão adicional de cepas aumentaria o potencial de tipabilidade em 7%; ou seja, a capacidade de diferenciar cepas aumentaria de 77% para 84%, ou talvez 86%, se a tipagem de fago fosse incluída. Concluímos que mais de uma das técnicas relatadas neste artigo deve ser utilizada para alcançar um nível aceitável de tipabilidade desta espécie.