Estrutura Cristalina da DNA Polimerase β de Rato: Evidência de um Mecanismo Comum de Polimerase

As estruturas do domínio catalítico de 31 quilodaltons da DNA polimerase beta de rato (pol beta) e da enzima completa de 39 quilodaltons foram determinadas com resoluções de 2,3 e 3,6 angstrons, respectivamente. O domínio de 31 quilodaltons é composto por subdomínios de dedos, palma e polegar dispostos para formar um canal de ligação ao DNA semelhante aos domínios de polimerase do fragmento Klenow da DNA polimerase I de Escherichia coli, da transcriptase reversa do HIV-1 e da RNA polimerase do bacteriófago T7. O domínio amino-terminal de 8 quilodaltons está ligado ao subdomínio de dedos por uma dobradiça flexível. Os dois aspartatos invariantes encontrados em todas as sequências de polimerase e implicados na atividade catalítica apresentam a mesma disposição geométrica dentro de palmas estruturalmente semelhantes, mas topologicamente distintas, indicando que as polimerases mantiveram, ou possivelmente re-evolveram, um mecanismo comum de transferência nucleotidil. A localização do Mn2+ e do trifosfato de desoxiadenosina em pol beta confirma o papel dos aspartatos invariantes na ligação de íons metálicos e trifosfatos de desoxirribonucleosídeos.