Preferências conformacionais de aminoácidos em proteínas globulares

Em um artigo anterior, Levitt, M., e Greer, J. (1977), J. Mol. Biol. 114, 181--239, uma compilação objetiva das regiões de estrutura secundária em mais de 50 proteínas globulares diferentes foi produzida automaticamente. No presente artigo, essas atribuições de estrutura secundária são analisadas para dar a frequência de ocorrência dos 20 aminoácidos que ocorrem naturalmente na estrutura secundária de hélice alfa, folha beta e vira reversa. Dezenove desses aminoácidos têm uma preferência fraca, mas estatisticamente significativa, por apenas um tipo de estrutura secundária. Essas preferências correlacionam-se bem com a estrutura química dos aminoácidos em particular, oferecendo uma classificação mais objetiva das propriedades conformacionais dos aminoácidos do que estava disponível anteriormente.