Descoberta de Relações Causais em um Caminho de Regulação Gênica a Partir de uma Mistura de Dados Experimentais e Observacionais de Microarrays de DNA

Este artigo relata os métodos e resultados de uma busca baseada em computador por relações causais no caminho de regulação gênica do metabolismo da galactose na levedura Saccharomyces cerevisiae. A busca utiliza dados recentemente publicados de experimentos de microarrays de cDNA. Um método bayesiano foi aplicado para aprender redes causais a partir de uma mistura de dados de expressão gênica observacionais e experimentais. Os dados observacionais foram os níveis de expressão gênica obtidos a partir de células "tipo selvagem" não manipuladas. Os dados experimentais foram produzidos pela deleção ("knockout") de genes e pela observação dos níveis de expressão de outros genes. Relações causais previstas a partir da análise de 36 pares de genes de galactose são relatadas e comparadas com o caminho conhecido da galactose. Análises exploratórias adicionais também são relatadas.