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Avanços recentes em sequenciamento de DNA/RNA permitiram identificar novos alvos rapidamente e reposicionar medicamentos aprovados para tratar doenças heterogêneas por meio do 'alvo' preciso de módulos de doenças individualizados. Neste estudo, desenvolvemos um algoritmo de rede de Sistemas de Posicionamento Genômico (GPSnet) para reposicionamento de medicamentos, visando especificamente módulos de doenças derivados dos perfis de sequenciamento de DNA e RNA de pacientes individuais mapeados para a rede de interações proteína-proteína humana. Investigamos perfis de sequenciamento de exoma completo e transcriptoma de ~5.000 pacientes em 15 tipos de câncer do The Cancer Genome Atlas. Mostramos que os módulos de doenças previstos pelo GPSnet podem prever respostas a medicamentos e priorizar novas indicações para 140 medicamentos aprovados. Importante, validamos experimentalmente que um medicamento aprovado para arritmia cardíaca e insuficiência cardíaca, a ouabaina, mostra potenciais atividades antitumorais em adenocarcinoma pulmonar, visando de forma única uma via de metabolismo celular mediada por HIF1α/LEO1. Em resumo, o GPSnet oferece uma estrutura de reposicionamento de medicamentos baseada em rede, in silico, para seleções terapêuticas mais eficazes.
Cheng et al. (Sex,) estudaram essa questão.
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