Enovelamento da estrutura terciária do RNA: Ligandos entre fosfatos da espinha dorsal, íons e água

As formas funcionais de muitos RNAs apresentam arquiteturas compactas. A colocação de fosfatos dentro de tais estruturas deve ser influenciada não apenas pela forte repulsão eletrostática entre fosfatos, mas também por redes de interações entre fosfatos, água e íons móveis. Esta revisão explora primeiro o que foi aprendido sobre as restrições termodinâmicas básicas nesses arranjos a partir de estudos de hidratação e íons em moléculas de DNA simples, e depois fornece uma visão geral do que se sabe sobre as interações de íons e água com estruturas de RNA. Uma breve pesquisa das estruturas cristalinas de RNA identifica várias arquiteturas interessantes nas quais fosfatos próximos compartilham camadas de hidratação ou onde fosfatos estão enterrados em ambientes que proporcionam ligações de hidrogênio intramoleculares ou cátions ligados ao local. A formação dessas estruturas deve exigir um forte acoplamento entre a absorção de íons e a liberação de água.