Insights ecológicos sobre as interações do microbioma entre domínios no morcego hematófago Desmodus rotundus

Resumo: Contexto: Os morcegos são reconhecidos como reservatórios para uma ampla gama de microrganismos, incluindo vírus, bactérias, fungos e parasitas, alguns dos quais são de preocupação zoonótica. O morcego-vampiro comum (Desmodus rotundus) é particularmente importante devido ao seu comportamento alimentar hematófago e adaptabilidade ecológica, ambos os quais aumentam seu potencial de transmissão de patógenos entre espécies. Apesar de sua relevância bem estabelecida para a saúde pública, as comunidades microbianas associadas ao D. rotundus permanecem mal caracterizadas. Este estudo teve como objetivo investigar a composição, diversidade e interações das comunidades procarióticas, eucarióticas e virais, juntamente com fontes alimentares, utilizando sequenciamento de alta produtividade em 27 indivíduos de D. rotundus de uma área rural em Casanare, na Colômbia oriental. Resultados: Analisamos um total de 81 amostras (sangue, fezes e swabs orais) usando sequenciamento de amplicon de leitura longa dos genes 16S e 18S-rRNA e metagenômica viral via Oxford Nanopore Technologies. Os perfis microbianos revelaram assemblages altamente diversas, englobando uma ampla gama de táxons bacterianos, fúngicos, parasitas e virais eucarióticos, com variação significativa na estrutura da comunidade e métricas de diversidade entre os três tipos de amostras coletadas de cada morcego. Táxons de preocupação para a saúde pública foram detectados, incluindo Enterococcus faecalis, Mycoplasma spp., Acanthamoeba spp. e vírus das famílias Coronaviridae, Retroviridae e Circoviridae. Análises de correlação sugeriram possíveis interações intra e inter-domínio e dinâmicas de coocorrência entre esses microrganismos. Além disso, o perfil das fontes alimentares, baseado em atribuições de vertebrados a partir de fezes e amostras de swabs, indicou evidências de consumo de gado, sugerindo possíveis vias de transmissão entre morcegos e animais domésticos. Conclusões: A detecção de múltiplos patógenos coocorrentes em distintos tipos de amostras, juntamente com sua associação com fontes alimentares, destaca o papel do D. rotundus como um reservatório funcionalmente especializado capaz de abrigar e potencialmente disseminar micróbios zoonóticos. Este estudo fornece novas percepções sobre a ecologia microbiana entre domínios dos morcegos hematófagos e sublinha a necessidade de integrar perfis de comunidade microbiana com dados comportamentais do hospedeiro para aprimorar estratégias de vigilância e mitigação para a transmissão de doenças zoonóticas.