Classificação de bacteriófagos Myoviridae usando similaridade de sequências de proteínas

JUSTIFICATIVA: Defendemos a unificação da classificação clássica e genômica de bacteriófagos por meio da integração de dados proteômicos e parâmetros físico-químicos. Nossa aplicação anterior dessa abordagem aos membros totalmente sequenciados de Podoviridae apoiou integralmente a classificação atual de fagos do International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Aparentemente, a transferência horizontal de genes geralmente não elimina por completo as relações evolutivas entre os fagos. RESULTADOS: Técnicas de comparação de proteomas com CoreGenes/CoreExtractor aplicadas a 102 Myoviridae sugerem o estabelecimento de três subfamílias (Peduovirinae, Teequatrovirinae, as Spounavirinae) e oito novos gêneros independentes (vírus semelhantes a Bcep781, BcepMu, FelixO1, HAP1, Bzx1, PB1, phiCD119 e phiKZ). A subfamília Peduovirinae, derivada dos fagos relacionados a P2, é composta por dois gêneros distintos: os "P2-like viruses" e os "HP1-like viruses". Atualmente, a subfamília mais complexa Teequatrovirinae possui dois gêneros, os vírus "T4-like" e "KVP40-like". No gênero "T4-like viruses" propriamente dito, quatro grupos que compartilham >70% de proteínas são distinguidos: vírus do tipo T4, tipo 44RR, tipo RB43 e tipo RB49. As Spounavirinae contêm os vírus "SPO1-" e "Twort-like". CONCLUSÃO: O agrupamento hierárquico desses agrupamentos fornece subdivisões biologicamente significativas, que são consistentes com nossa análise anterior dos Podoviridae.