DIANA miRPath v.2.0: investigando o efeito combinatório de microRNAs em vias

MicroRNAs (miRNAs) são reguladores chave de diversos processos biológicos e sua análise funcional tem sido considerada central em muitos pipelines de pesquisa. A nova versão do servidor web DIANA-miRPath foi redesenhada do zero. O usuário da Análise Inteligente de DNA (DIANA) DIANA-miRPath v2.0 agora pode utilizar alvos de miRNA previstos com alta precisão com base no DIANA-microT-CDS e/ou alvos experimentalmente verificados do TarBase v6; combinar resultados com algoritmos de fusão e meta-análise; realizar agrupamento hierárquico de miRNAs e vias com base em seus níveis de interação; bem como elaborar visualizações sofisticadas, como dendrogramas ou mapas de calor de miRNA versus via, a partir de uma interface web intuitiva e fácil de usar. Novos módulos permitem que o servidor DIANA-miRPath forneça informações sobre polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) patogênicos em locais-alvo de miRNA (módulo SNPs) ou para anotar todos os alvos de miRNA previstos e validados experimentalmente em uma via molecular selecionada (módulo Reverse Search). DIANA-miRPath v2.0 é uma ferramenta eficiente e, ao mesmo tempo, fácil de usar, que pode ser incorporada com sucesso em pipelines de análise relacionados a miRNA. Ele fornece pela primeira vez uma série de ferramentas altamente específicas para a análise de vias alvo de miRNA por meio de uma interface web e pode ser acessado em http://www.microrna.gr/miRPathv2.