Fatores de splicing ricos em serina/arginina pertencem a uma classe de proteínas intrinsecamente desordenadas

Fatores de splicing ricos em serina/arginina (SR) desempenham um papel importante no splicing constitutivo e alternativo, bem como durante várias etapas do metabolismo do RNA. Apesar da riqueza de informações funcionais sobre proteínas SR acumuladas até hoje, o conhecimento estrutural sobre os membros desta família é muito limitado. Para obter uma melhor perspectiva sobre as relações estrutura-função das proteínas SR, realizamos uma extensa análise de sequência dos membros da família de proteínas SR e a combinamos com previsões de estrutura ordenada/desordenada. Descobrimos que as proteínas SR têm propriedades características de proteínas intrinsecamente desordenadas (ID). A composição de aminoácidos e a complexidade da sequência das proteínas SR eram muito semelhantes às das regiões de proteínas desordenadas. Análises mais detalhadas mostraram que as proteínas SR, e seus domínios RS em particular, são enriquecidos em resíduos que promovem desordem e são empobrecidos em resíduos que promovem ordem em comparação com o proteoma humano inteiro. Além disso, previsões de desordem indicaram que os domínios RS das proteínas SR eram completamente desestruturados. Dois métodos de classificação diferentes, a medida de carga-hidropatia e a função de distribuição acumulada (CDF) dos escores de desordem, estavam em concordância entre si, e ambos previram fortemente que os membros da família de proteínas SR seriam desordenados. Este estudo enfatiza a importância da estrutura desordenada para várias funções das proteínas SR, como a montagem do spliceossomo e a interação com múltiplos parceiros. Além disso, demonstra a utilidade das previsões de ordem/desordem para inferir a estrutura da proteína a partir da sequência.