Os repertórios de receptores de células T compartilham um conjunto restrito de sequências CDR3 públicas e abundantes que estão associadas à imunidade relacionada ao self

O repertório de receptores de células T (TCR) é formado por recombinações aleatórias de elementos precoces genômicos; a diversidade combinatória resultante torna improvável o compartilhamento extensivo de TCR entre indivíduos. Aqui, estudamos o compartilhamento de sequências de aminoácidos CDR3β de forma ampla no repertório, utilizando TCR-seq de alta capacidade em 28 camundongos saudáveis. Descobrimos centenas de sequências públicas compartilhadas pela maioria dos camundongos. As sequências públicas de CDR3, em relação às sequências privadas, são duas ordens de magnitude mais abundantes em média, expressam segmentos V/J restritos e apresentam alta recombinação de ácidos nucleicos convergentes. Funcionalmente, as sequências públicas são enriquecidas por sequências CDR3 diversas de MHC que foram anteriormente associadas a reações autoimunes, de aloenxertos e relacionadas a tumores, mas não com reações anti-patógenos. As sequências públicas de CDR3 são compartilhadas entre camundongos de diferentes haplótipos de MHC, mas estão associadas a diferentes genes V dependentes de MHC. Assim, apesar de seu processo de geração aleatória, os repertórios de TCR expressam um grau de uniformidade em sua organização pós-genômica. Esses resultados, juntamente com simulações numéricas de rearranjos genômicos de TCR, sugerem que viés e convergência na recombinação de TCR se combinam com seleção contínua para gerar um subconjunto restrito de sequências CDR3 TCR públicas associadas ao self, e convidam a uma reavaliação dos mecanismos básicos de formação do repertório de células T.