Novas Ferramentas para Identificação de Genes de Doenças Mendelianas: Módulo de Análise de Variantes do PhenoDB; e GeneMatcher, uma Ferramenta Baseada na Web para Conectar Investigadores com Interesse no Mesmo Gene

Identificar a variante causadora entre as milhares identificadas por sequenciamento de exoma completo ou sequenciamento de genoma completo é um desafio formidável. Para tornar esse processo o mais eficiente e flexível possível, desenvolvemos um Módulo de Análise de Variantes acoplado à nossa ferramenta de entrada de fenótipo baseada na Web anteriormente descrita, PhenoDB (http://researchphenodb.net e http://phenodb.org). Quando um pequeno número de variantes candidatas causadoras foi identificado em um estudo de um determinado paciente ou família, um segundo desafio, mais difícil, torna-se a prova de causalidade para qualquer variante dada. Uma abordagem para esse problema é encontrar outros casos com um fenótipo semelhante e mutações no mesmo gene candidato. Alternativamente, pode ser possível desenvolver evidências biológicas para a causalidade, uma abordagem que é assistida por conexões com cientistas básicos que estudam o gene de interesse, frequentemente no contexto de um organismo modelo. Ambas as estratégias se beneficiam de um site online de acesso aberto onde clínicos e investigadores individuais podem postar genes de interesse. Para esse fim, desenvolvemos o GeneMatcher (http://genematcher.org), um site acessível gratuitamente que permite conexões entre clínicos e pesquisadores em todo o mundo que compartilham interesse nos mesmos gene(s).