Um Método Filogenético Bayesiano para Estimar Idades de Sequências Desconhecidas

Conjuntos de dados heterocronos compreendem sequências moleculares amostradas em diferentes pontos no tempo. Se o intervalo temporal das sequências amostradas for grande em relação à taxa de mutação, os tempos de amostragem podem calibrar diretamente as taxas evolucionárias em relação ao tempo calendario. Aqui, estendemos esse processo de calibração para fornecer um método probabilístico completo que utiliza informações temporais em conjuntos de dados heterocronos para estimar os tempos de amostragem (idades das folhas) para sequências para as quais essa informação não está disponível. Nosso método é semelhante a relaxar as restrições do relógio molecular em linhagens específicas dentro de uma árvore filogenética. Usando uma combinação de conjuntos de dados sintéticos e empíricos, demonstramos que o método estima idades das folhas de forma confiável e precisa. Aplicações potenciais de nossa abordagem incluem a incorporação de amostras de idade incerta ou infinita em análises de DNA antigo, a avaliação do sinal temporal em uma sequência ou conjunto de dados particular e a exploração da confiabilidade das idades das sequências que são, de alguma forma, controversas.